黑龍江省中醫(yī)研究院的前身是成立于1957年的“黑龍江省祖國(guó)醫(yī)藥研究所”（俗稱“祖研”），是全國(guó)成立最早的省級(jí)中醫(yī)藥科研醫(yī)療機(jī)構(gòu)之一。隨著規(guī)模的發(fā)展和功能的不斷健全，1985年更名為“黑龍江省中醫(yī)研究院”。為了充分發(fā)揮醫(yī)院的中醫(yī)醫(yī)療優(yōu)勢(shì)，1995年經(jīng)黑龍江省編委批準(zhǔn)加掛了“黑龍江省中醫(yī)醫(yī)院”的牌匾，同年被評(píng)為三級(jí)甲等中醫(yī)醫(yī)院；現(xiàn)已發(fā)展成為集醫(yī)療、科研和研究生教育于一體的綜合性中醫(yī)藥科研醫(yī)療機(jī)構(gòu)。先后被確定為黑龍江省和哈爾濱市城鎮(zhèn)職工醫(yī)療保險(xiǎn)和哈爾濱鐵路醫(yī)保定點(diǎn)醫(yī)院。先后兩次榮獲衛(wèi)生部、國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理局、國(guó)家中醫(yī)藥管理局聯(lián)合授予的“全國(guó)衛(wèi)生系統(tǒng)先進(jìn)集體”的榮譽(yù)稱號(hào)。2008年被國(guó)家中醫(yī)藥管理局確定為重點(diǎn)中醫(yī)院建設(shè)項(xiàng)目單位。2009年被國(guó)家科技部確定為中藥研發(fā)技術(shù)創(chuàng)新服務(wù)平臺(tái)建設(shè)單位。2010年在國(guó)家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)醫(yī)院管理年活動(dòng)檢查評(píng)估中取得黑龍江省第一名、全國(guó)第五名的好成績(jī)。2010年被黑龍江省委、省政府評(píng)為推進(jìn)八大經(jīng)濟(jì)區(qū)和十大工程建設(shè)先進(jìn)單位。

　　醫(yī)院占地面積20000平方米，建筑面積50000平方米。醫(yī)院現(xiàn)有人員1192人，其中在編職工526人，聘用人員666人,在崗專業(yè)技術(shù)人員980人,在編人員中具有正、副高級(jí)職稱專家222人，其中享受省政府和國(guó)務(wù)院特殊津貼專家22人，國(guó)家級(jí)名中醫(yī)和省級(jí)名中醫(yī)20人。醫(yī)院現(xiàn)有國(guó)家臨床重點(diǎn)專科2個(gè)，國(guó)家中醫(yī)重點(diǎn)專科(專病)4個(gè)，國(guó)家中醫(yī)藥重點(diǎn)學(xué)科4個(gè)，國(guó)家中醫(yī)重點(diǎn)研究室1個(gè)，國(guó)家三級(jí)實(shí)驗(yàn)室5個(gè)，省政府重點(diǎn)學(xué)科7個(gè)，省級(jí)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1個(gè)，省衛(wèi)生廳重點(diǎn)學(xué)科7個(gè)。同時(shí)醫(yī)院下設(shè)中藥、中醫(yī)臨床和針灸經(jīng)絡(luò)研究所3個(gè)，國(guó)家中藥劑型改革基地設(shè)在醫(yī)院。

醫(yī)院醫(yī)療部分編制床位1006張,設(shè)內(nèi)、外、婦、兒、骨、針灸、推拿、口腔、眼科等醫(yī)療一級(jí)科室19個(gè)，醫(yī)療二級(jí)分科16個(gè)，專科專病診室30個(gè)，設(shè)CT、核磁、DR、彩超、鉬靶、檢驗(yàn)等醫(yī)技科室23個(gè)，其中腎病科、心血管科、針灸科、皮膚科為國(guó)家中醫(yī)重點(diǎn)專科；腎病科、中藥劑型、針灸科、皮膚科為國(guó)家中醫(yī)藥重點(diǎn)學(xué)科；內(nèi)分泌科、脾胃病科、肺病科為省政府重點(diǎn)學(xué)科。其中腎病科在全國(guó)所有中醫(yī)重點(diǎn)專科中規(guī)模最大，擁有固定床位350張，腎病免疫實(shí)驗(yàn)室為國(guó)家三級(jí)實(shí)驗(yàn)室；針灸科設(shè)床位235張，并配有功能齊全的現(xiàn)代化康復(fù)中心。

在研究生教育方面，醫(yī)院擁有一級(jí)學(xué)科中醫(yī)學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合、中藥學(xué)的碩士學(xué)位授予權(quán)，碩士研究生導(dǎo)師55名，博士研究生導(dǎo)師6名，現(xiàn)在院研究生130名。1999年醫(yī)院被人事部批準(zhǔn)為博士后科研工作站，現(xiàn)已有9名博士后出站，有4名博士后在站工作。

建院以來(lái)，醫(yī)院共取得科研成果343項(xiàng)，其中獲得部省級(jí)以上科技獎(jiǎng)勵(lì)110項(xiàng)，目前醫(yī)院已承擔(dān)部省級(jí)以上課題131項(xiàng)，其中國(guó)家級(jí)10項(xiàng)，部省級(jí)62項(xiàng)。共研制出中藥新產(chǎn)品43個(gè)投放市場(chǎng)，其中包括“刺五加”、“滿山紅”、“注射用雙黃連粉針劑”等具有里程碑意義的名牌產(chǎn)品，據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，2009年醫(yī)院轉(zhuǎn)讓黑龍江省企業(yè)的中藥產(chǎn)品年創(chuàng)產(chǎn)值近10億元，約占黑龍省中藥產(chǎn)值的1/4，其中“雙黃連粉針劑”自投產(chǎn)以來(lái)已創(chuàng)產(chǎn)值達(dá)35億元以上，為黑龍江省醫(yī)藥工業(yè)和中藥產(chǎn)業(yè)化發(fā)展提供了強(qiáng)有力的科技支撐。